Le Conseil d’administration du Cégep de Jonquière est la plus haute instance du collège où l’on prend des décisions d’ordres administratives, pédagogiques et culturelles.
Ces décisions influenceront la vie de l’ensemble du personnel et des étudiants.

À noter que deux représentantes étudiantes y siègent, soit une représentante du secteur techniques et une seconde du secteur pré-universitaire. Elles seront élues lors d’une assemblée générale des membres. Leur principale tâche sera de veiller aux intérêts des étudiants.